基于多组学数据识别癌症驱动通路的模型和算法

来源 :计算机科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:tuaa29801
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
通过整合体细胞突变、拷贝数变异和基因表达等3种组学数据,提出识别癌症驱动通路的改进最大权重子矩阵模型。该模型用通路中基因平均权重调控覆盖度和互斥度,对权重大的基因集覆盖度进行加强,同时放松其高互斥度约束。引入基于贪心算法的重组算子,提出求解该模型的单亲遗传算法PGA-MWS。采用胶质母细胞瘤和卵巢癌数据集对算法PGA-MWS和GA进行实验对比分析。实验结果显示,较GA方法,基于改进模型的PGA-MWS算法能识别出覆盖度高但互斥度不太高的基因集,且其识别的基因集中,许多均参与已知信号通路,并被证实与癌细胞密
其他文献
新城疫(Newcastle Disease,ND)是一种急性、烈性呼吸道传染病,是由新城疫病毒(Newcastle Disease Virus,NDV)引发的禽类疫病,严重威胁了养禽业的发展,已被世界动物卫生组织列为必须通报的疫病。NDV是具有囊膜包裹的单股负链RNA病毒,其基因组能编码六个结构蛋白和两个非结构蛋白。其中,核衣壳蛋白(nucleocapsid protein,NP)是NDV基因组中
对老年糖尿病患者加强糖尿病知识教育,提高患者及家属的知识水平,了解低血糖的常见病因、症状及简单的急救方法,预防低血糖的发生发展,降低低血糖的损害,提高生活质量。
利用气相色谱对五种产自俄罗斯、瑞典、美国的伏特加酒和四种不同香型的传统白酒进行了检测。结果表明,伏特加酒试样的杂醛和杂醇含量都很低,其中UVVODKA试样酒中的杂醛总量
作为会计规范体系中不可或缺的部分,会计法律规范以法律的形式对会计行为进行约束,对保证会计信息质量方面起着重要的作用。然而目前我国会计信息失真现象在国家颁布各种会计法
以莫友芝为主要代表的影山文化是晚清以来在中国具有巨大影响力的一种地域文化。文章首先详细分析了其产生形成的历史时期、文化源头基础、学校教育基础、家学渊源基础、代表
目的回顾分析颅内血管周细胞瘤(hemangiopericytomas,HPCs)的常规和功能MR成像表现及病理组织学特点,以提高其影像诊断的准确率。方法收集7例经病理证实的颅内HPCs(intracrani-a
《幼儿舞蹈创编》课程是中职学前教育专业综合性和实践性较强的一门课程,对学生的理论知识和实践能力提出较高的要求。本文以中职学前教育幼儿舞蹈创编教学现状为切入点,论述
目的探索糖尿病患者有效的教育方式,研究个体化教育的方法及效果。方法将2012年1月—2013年12月期间该院对150例新诊断的糖尿病患者分为两组,A组实施个体化教育,B组进行一般
为尽快形成与页岩油勘探开发相配套的测井评价技术,在对国内外页岩油气最新研究成果,尤其是北美页岩气测井评价现状调研的基础上,结合区域地质特征,得出东濮凹陷页岩油测井评
当前,受应试教育影响,教师的"育人"观念存在偏差,对学生个性发展的关注度不够。那么,如何让每一个学生的个性都能得到充分发展呢?这就要求教师树立正确的人才观、功利观、教学观