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Bacillus velenzensis S3-1基因组中表面活性素、伊枯草菌素和丰原素合成基因簇的定位与分析

来源 :上海师范大学学报：自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户：wangyiming1

【摘 要】

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通过Gen Bank数据库寻找能产生表面活性素、伊枯草菌素或丰原素并在基因组中其合成基因已得到注释的芽胞杆菌,经过BLAST比对序列初步确定这三类脂肽类抗菌肽的合成基因簇的位

【作 者】

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金清 张蕾 蒋秋悦 苏翠珠 肖明 

【机 构】

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上海师范大学生命与环境科学学院,农业部都市农业重点实验室

【出 处】

：

上海师范大学学报：自然科学版

【发表日期】

：

2018年04期

【关键词】

：

生物信息学 Bacillus velezensis S3-1 表面活性素 伊枯草菌素 丰原素 

【基金项目】

：

上海市2016年度“科技创新行动计划”项目（16391902100）,农业部都市农业重点实验室开放基金（UA201705）

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通过Gen Bank数据库寻找能产生表面活性素、伊枯草菌素或丰原素并在基因组中其合成基因已得到注释的芽胞杆菌,经过BLAST比对序列初步确定这三类脂肽类抗菌肽的合成基因簇的位置,再运用anti SMASH进行其合成基因簇的最终定位.对表面活性素、伊枯草菌素和丰原素的结构及相关的合成酶结构域进行了预测与分析.

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