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医疗服务代理关系具有供方主导性，与现行的以项目付费为代表的后付制结合，诱导了医院提供过度医疗服务的动机，从而降低了医疗资源使用效率。而国家以被代理人身份对医院所采取的“超支不补、结余留用”激励制度，加剧了后付制缺陷，并进一步扭曲了医疗服务关系。以病种付费为代表的预付制的应用能够均衡医疗服务市场供需力量，防止对医院激励过当，但是与其配套的医院成本核算的目标与医疗服务产品错位，有产品而无产品成本。为此，需要发掘医疗成本的价格发现功能，为预付制提供定价依据。