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莛子藤是莛子蔗属的一种多年生草本植物，主要分布在青藏高原东北部及邻近高山地区和日本，为东亚特有种。本文基于叶绿体DNA基因间隔区rbcL—accD序列，对莛子蔗物种水平的序列特征、分子遗传多样性和谱系地理结构进行研究。分析结果发现该区域莛子藤种群的遗传变异主要来自于居群间（72．28％），优势单倍型（H2）广泛分布，特有单倍型分散在多个居群。居群间遗传分化系数NST〈GST没有检测到显著谱系地理结构，而且居群间基因流较低（Nm=0．096），青藏高原及其邻近地区特殊地形和生态环境造成的地理隔离或者生境异质