【摘 要】
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GRF转录因子参与多种生长发育过程,包括根、茎、叶和花的发育等.本研究基于荔枝转录组测序结果,共鉴定出22个GRF基因并分析其蛋白理化性质、系统进化、基因结构、miRNA靶基因和组织表达分析.结果表明,22个GRF蛋白的大小为72～246 aa,分子量为8 055.41～250 929.9 Da,等电点为4.96～10.44.大部分GRF蛋白为亲脂蛋白并主要定位于细胞核中.系统进化分析将其分为6类,相较于水稻,荔枝与拟南芥GRF的亲缘关系更近.22个GRF基因均含有WRC或QLQ结构域,同一类基因含有相似
【机 构】
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海南省农业科学院热带果树研究所,海南省热带果树生物学重点实验室,农业部海口热带果树科学观测实验站,海口,571100
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GRF转录因子参与多种生长发育过程,包括根、茎、叶和花的发育等.本研究基于荔枝转录组测序结果,共鉴定出22个GRF基因并分析其蛋白理化性质、系统进化、基因结构、miRNA靶基因和组织表达分析.结果表明,22个GRF蛋白的大小为72～246 aa,分子量为8 055.41～250 929.9 Da,等电点为4.96～10.44.大部分GRF蛋白为亲脂蛋白并主要定位于细胞核中.系统进化分析将其分为6类,相较于水稻,荔枝与拟南芥GRF的亲缘关系更近.22个GRF基因均含有WRC或QLQ结构域,同一类基因含有相似的基序.miRNA靶基因预测发现荔枝中有14个GRF是miRNA的靶基因,并且均通过mRNA裂解的方式抑制其表达.表达相关性分析表明,10个GRF基因与GA相关基因的表达存在显著或极显著的正相关.大部分GRF基因的表达水平在\'妃子笑\'中高于\'紫娘喜\',且大部分基因在顶芽的表达水平显著高于叶.而两个品种中,LcGRF1、LcGRF20和LcGRF22的表达水平均呈现叶高于顶芽的表达模式,表明其可能参与叶的发育调控.本研究为进一步研究荔枝GRF基因的功能提供了科学依据.
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为了克隆荸荠AGPase大亚基基因(EdAGPL1)cDNA序列,分析其序列结构特征及其在荸荠不同组织和球茎发育过程的表达情况.以荸荠\'桂林马蹄\'为研究材料,通过RT-PCR技术克隆得到EdAGPL1基因并对其进行生物信息学分析,采用实时荧光定量PCR技术分析其不同组织和球茎发育过程的表达情况.结果 表明,克隆获得EdA GPL1基因长度为1744 bp,其开放阅读框为1599 bp,编码532个氨基酸,蛋白质分子质量为58.84 kD,等电点为7.54,具有NTP transferase和P
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为探究灯盏花Eb14-3-3基因表达特征,本研究从灯盏花基因组数据库中克隆了拟南芥同源基因灯盏花14-3-3v序列信息,利用生物信息学方法对该蛋白的功能和活性位点进行预测,通过荧光定量PCR分析在非生物胁迫条件下该基因的表达变化.结果表明,Eb14-3-3的ORF序列长804 bp,编码267个氨基酸;该蛋白的分子量和理论等电点分别为65 296kD和5.16.Eb14-3-3蛋白序列中富含磷酸化位点,为一个非分泌型蛋白,并且在其结构中无跨膜结构域.二级结构分析显示有156个α-螺旋,47个片层延伸,9个
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茉莉花茶属于中国的一种特种茶,深受消费者喜爱,具有广阔的市场前景.茉莉花作为茉莉花茶窨制的主要原材料,其质量与香气决定着茉莉花茶质量的优劣,茉莉花的香气独特且浓郁,其释香与花瓣的开放相伴发生.本研究通过对茉莉花开放前后的全长差异性消减文库进行构建获得了 131个差异表达基因,并且从差异表达基因中筛选香气合成相关的基因,进一步从筛选结果中分离出催化苯甲醇合成的香气释放相关基因JsBEFBT,其开放阅读框全长1 404 bp,编码467个氨基酸,JsBEBT在茉莉花活体条件下开放过程和茉莉花瓣离体养护过程的表
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