基于图神经网络协同过滤的药物疾病关联预测

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新药开发需要耗费很高的成本,建立高效且高准确度的药物新适应症预测方法非常重要,提出一种基于图神经网络协同过滤的药物疾病关联预测方法,获取药物与疾病治疗关系中的信息并结合药物相似性获得更好的预测表现。首先通过图神经网络提取药物-疾病治疗关系数据中的协作信号细化药物嵌入,然后利用嵌入计算药物之间的治疗关系相似性,再结合药物化学结构、蛋白质和副作用相似性预测药物的新作用。与现有的协同过滤方法在相同数据集上进行对比,本文方法获得了较高的预测精确率(0.664 8)。所提出的获取药物-疾病治疗关系中的潜在信息并结合相似性进行药物疾病关联预测的策略是有效的,有助于发现药物的新适应症,为药物开发提供帮助。
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