论文部分内容阅读
【目的】环糊精水解酶是作用于特殊底物的水解酶，可以水解圆锥形结构的底物。分析这个酶的底物通道为水解特殊结构底物提供研究基础。【方法】利用分子动力学模拟环糊精水解酶存在的底物通道，比较环糊精水解酶BsCMD1JOH和TspCMD_1SMA在底物运输通道上的差异。[结果]BsCMD_110H和TspCMD_1SMA都为糖基水解酶家族13的蛋白质，它们的碳骨架基本吻合，而在α-螺旋分布上，TspCMD_1SMA相比于BsCMD_1J0H来说，螺旋结构更趋向于在蛋白质中心聚集。BsCMD_1J0H有6条底物通道连