【摘 要】
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通过对NCBI数据库的搜查,获得熊蜂CoI基因部分序列;设计引物,采用RT-PCR和RACE技术克隆了红光熊蜂CoI基因cDNA全长序列.采用DNAMAN 8.0,MEGA 7.0,Protparam和Automatic Modeling Mode等软件对该cDNA序列、基本理化性质、3-D结构、跨膜结构域及其系统进化关系进行了分析.结果表明:红光熊蜂CoI全长cDNA序列含1050 bp,编码349个氨基酸,对应的蛋白质相对分子质量为38350,预测其分子式为C1789 H2724 N422 O463
【机 构】
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辽东学院农学院,辽宁丹东118003;浙江大学爱丁堡大学联合学院,浙江海宁314499
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通过对NCBI数据库的搜查,获得熊蜂CoI基因部分序列;设计引物,采用RT-PCR和RACE技术克隆了红光熊蜂CoI基因cDNA全长序列.采用DNAMAN 8.0,MEGA 7.0,Protparam和Automatic Modeling Mode等软件对该cDNA序列、基本理化性质、3-D结构、跨膜结构域及其系统进化关系进行了分析.结果表明:红光熊蜂CoI全长cDNA序列含1050 bp,编码349个氨基酸,对应的蛋白质相对分子质量为38350,预测其分子式为C1789 H2724 N422 O463 S25,理论等电点(pI)5.79,偏酸性,半衰期为30 h;蛋白质平均亲水系数0.706,不稳定性指数39.98,脂溶性指数110.92.该蛋白质具8个α-螺旋、8个跨膜结构域,为稳定的疏水性蛋白质.系统发育显示红光熊蜂Co I氨基酸序列与同属地熊蜂的进化关系较近,表明红光熊蜂线粒体Co I基因序列保守性较高.
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