【摘 要】
：
为了获得姜荷花叶绿素降解的关键酶基因PPH信息,本试验在前期通过姜荷花全长转录组测序获得大量转录组信息的基础上,进行筛选分析,获得了2条PPH基因,分别命名为PPH1和PPH2.PP
【机 构】
：
浙江省萧山棉麻研究所,杭州,311202;浙江省萧山棉麻研究所,杭州,311202;绍兴文理学院元培学院,绍兴,312000
论文部分内容阅读
为了获得姜荷花叶绿素降解的关键酶基因PPH信息,本试验在前期通过姜荷花全长转录组测序获得大量转录组信息的基础上,进行筛选分析,获得了2条PPH基因,分别命名为PPH1和PPH2.PPH1基因(GenBank: MT077178),cDNA序列全长1 795 bp,开放阅读框1 437 bp (138～1 574 bp),编码一条478 aa的氨基酸序列.PPH2基因(GenBank: MT077179),cDNA序列全长1 393 bp,开放阅读框1 227 bp (70～1 296 bp),编码一条408 aa的氨基酸序列.采用BLAST、Translate tool (ExPASy)、Clustal Omega、Find Conserved Domains(NCBI)、ProtParam、TMHMMServer、SOPMA、SWISS-MODEL、ClustalX (1.81)、MEGA 4.1等预测和分析了这2个基因编码蛋白氨基酸的一级结构(包括氨基酸序列的组成,保守区,理化特征等)、二级结构、三级结构及分子系统进化关系.PPH1和PPH2的核苷酸与蛋白氨基酸序列与其它物种的PPH基因都具有很高的同源性,两者都包含有水解酶(Hydrolase)特征PLN02578的保守区.分子系统进化分析表明,姜荷花的PPH1和PPH2聚为一小类,然后与小果野芭蕉PPH (XP_018677219.1)的亲缘关系最为接近,而与双子叶植物的关系较远.本研究为后期通过遗传转化手段改良姜荷花不育苞片的颜色提供了分子基础.
其他文献
目的 评价综合护理干预对腔内心电图PICC尖端定位患者并发症发生率的影响.方法 选取我院2018年3月-2020年3月行腔内心电图PICC尖端定位的患者82例并为其编号,单号为参照组41
目的 研究肌钙蛋白I(cTnI)的检测在早期诊断急性心肌梗死(AMI)中的价值.方法 检测65例AMI患者血清中cTnI和CK-MB含量,并加以比较,正常对照组50例.结果 诊断AMI,胸痛持续发作3
目的 分析角膜塑形术对青少年近视发展的控制作用.方法 采用回顾性方法分析本院自2015年10月-2017年10月收治的90例青少年近视者的临床资料,根据治疗方式分为对照组与研究组,
中药加工炮制技术是在中医长期辩证用药基础上,积累和发展形成的一门历史悠久的传统制药技术,是中药传统制药技术的集中体现和核心.中药通过加工炮制能够对其组成成分和作用
为进一步研究atp6基因与大葱细胞质雄性不育的关系,以章丘大葱不育系和保持系作为本研究的实验材料,利用同源克隆的方法获得大葱atp6基因序列,并对其在蛋白质二级结构和生长
14-3-3蛋白是普遍存在于真核细胞中的蛋白质,在植物的生长发育、信号传导、抵御胁迫等方面发挥着重要的作用,编码14-3-3蛋白的基因以基因家族的形式存在.本试验利用BLASTp从
目的 对慢性心力衰竭病患采用沙库巴曲缬沙坦治疗的疗效进行观察分析.方法 选取我院收治的2019年10月-2020年10月收治的98例病患作为研究对象,随机将其分为对照组与观察组,每
IspH基因作为MEP途径中的关键酶具有促进下游萜类化合物产量的积累和提高植物对外界的抵御能力的特定作用,本研究旨在通过对烟草中IspH基因进行克隆与原核表达分析,从野生型
作为植物抗氧化防御系统的主要保护酶之一,过氧化氢酶在植物细胞响应逆境胁迫应答方面发挥重要作用.本研究通过生物信息学分析RNA-Seq数据(NCBI登录号:PRJNA285946),结合RT-P
基于基因组序列信息,研究了二倍体森林草莓和八倍体栽培草莓染色体上SSR位点的分布特点.利用AutoSSR软件在森林草莓和栽培草莓中分别发掘到153 826个和329 801个SSR位点,发生