2813条全长人类新基因编码蛋白质的功能预测

来源 :复旦学报(自然科学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:sylviawan
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用生物信息学序列分析方法对联合基因科技(集团)公司2813条全长人类新基因编码的蛋白质进行了功能预测.由WU-BLASTP核酸序列相似性分析结果表明P值小于le-20的基因合计有466条,占总分析基因的16.57%,P值在le-10以下的基因合计有565条,占总分析基因的20.09%;由蛋白质结构域分析结果表明,含PROSITE pattern的基因有520条,代表了107种pattern;含PROSITE profile的基因有333条,代表了200种profile;含PFAM结构域的基因有457条,代表了241个family;含PRINTS的家族指纹1型(class1)的基因有128条,指纹2型(class2)的有18条,总数为146条,代表了45种家族指纹;由特殊结构分析表明,跨膜蛋白470条,分泌蛋白677条,Coiled-coil蛋白228条,Helix-turn-helix蛋白73条.
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