【摘 要】
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本研究基于茄子自交系WT和L6-5重测序数据设计SNP特异引物,通过对反应体积、DNA用量和引物浓度等参数进行优化,建立了茄子PARMS (Penta-primer amplification re-fractory mutation system) SNP分型体系.研究结果表明最佳反应体系为6μL,其中1 μL DNA模板(10～100 ng/μL),3μL PARMS mix (2x),0.45 μL引物混合物(100 μmol/L),1.55 μL ddH2O.利用WT和L6-5的F2群体验证该体系
【机 构】
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中国热带农业科学院南亚热带作物研究所,湛江,524091;中国热带农业科学院南亚热带作物研究所,海南省热带园艺产品采后生理与保鲜重点实验室,湛江,524091;湛江市农业科学研究院,湛江,524091
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本研究基于茄子自交系WT和L6-5重测序数据设计SNP特异引物,通过对反应体积、DNA用量和引物浓度等参数进行优化,建立了茄子PARMS (Penta-primer amplification re-fractory mutation system) SNP分型体系.研究结果表明最佳反应体系为6μL,其中1 μL DNA模板(10～100 ng/μL),3μL PARMS mix (2x),0.45 μL引物混合物(100 μmol/L),1.55 μL ddH2O.利用WT和L6-5的F2群体验证该体系的稳定性,获得了较好的SNP分型结果.本研究建立的PARMS-SNP分型体系,为开展茄子种质资源遗传多样性分析、基因定位、指纹图谱构建和分子标记辅助选择等提供了技术支持.
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