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基于基尼系数与泰尔指数等测度方法，对我国2003-2009年医药制造业总产值、主营业务收入和利润总额三方面指标进行区域差异分析得出：我国各省医药制造业的绝对差异在逐年扩大，而相对差异在总体上有逐年减小的趋势，东部、中部和西部三大区域间的差异是构成总差异的主要因素，西部地区的内部差异比东、中部地区要小。