【摘 要】
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目的 了解上海市普陀区哨点医院食源性疾病病例诺如病毒的感染情况和病毒基因特征,为辖区内诺如病毒引起的感染性腹泻病的防控提供科学依据.方法 收集2018年1月至2019年12月上海市普陀区哨点监测医院的食源性疾病病例的肛拭标本和流行病学资料,采用实时荧光定量逆转录PCR方法检测诺如病毒,部分阳性标本使用逆转录PCR的方法扩增聚合酶-衣壳蛋白链接区并测序,通过生物信息软件进行基因分型和系统进化分析.结果 诺如病毒阳性检出率33.33％ (134/402),以诺如病毒GII组为主(65.67％,88/134);
【机 构】
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上海市普陀区疾病预防控制中心,上海200333
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目的 了解上海市普陀区哨点医院食源性疾病病例诺如病毒的感染情况和病毒基因特征,为辖区内诺如病毒引起的感染性腹泻病的防控提供科学依据.方法 收集2018年1月至2019年12月上海市普陀区哨点监测医院的食源性疾病病例的肛拭标本和流行病学资料,采用实时荧光定量逆转录PCR方法检测诺如病毒,部分阳性标本使用逆转录PCR的方法扩增聚合酶-衣壳蛋白链接区并测序,通过生物信息软件进行基因分型和系统进化分析.结果 诺如病毒阳性检出率33.33％ (134/402),以诺如病毒GII组为主(65.67％,88/134);诺如病毒检出阳性率在不同性别、不同年龄组、不同职业的差异均有统计学意义(P＜0.05),阳性病例和阴性病例在发热、恶心、呕吐、腹痛等临床特征的差异有统计学意义(P＜0.05),春季和冬季是诺如病毒高发季节.45份诺如病毒测序成功,通过序列比对分析获得15种基因型别,GⅠ组以GⅠ.P13-GⅠ.3型和GⅠ.P4-GⅠ.4型为主,GⅡ组以GⅡ.P17-GⅡ.17型和GⅡ.P16-GⅡ.2型为主.同源性和遗传进化分析结果显示:8株GⅡ.P17-GⅡ.17型核苷酸同源性为98.2％～100％,与参考株MN461100.1同源性差异最大;7株GⅡ.P16-GⅡ.2型与参考株均在同一进化分支上,与日本的AB629946.1参考株同源性差异最大;其余基因型别与所选参考株均在同一进化分支上.结论 诺如病毒是上海市普陀区食源性疾病的重要病原体,基因型别存在多样性,GⅡ.P17-GⅡ.17型和GⅡ.P16-GⅡ.2型是2018-2019年的主要流行株.
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