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目的基于中药系统药理学数据库和分析平台TCMSP，运用计算机虚拟筛选技术寻找SARS-CoV-2 3CL水解酶的中药小分子抑制剂，推测潜在抗新型冠状病毒肺炎（COVID-19）中药及中药复方。方法本研究以SARS-CoV-2 3CL水解酶蛋白为靶点，利用Autodock Vina软件和Python脚本实现高通量分子对接，结合“ADME-Lipinski”规则进行再次筛选，以优选活性成分，推测关键中药及复方。基于网络药理学角度，构建成分-靶点-通路网络，推测核心药对的作用机制。结果以lopinavir/ritonavir复方制剂为阳性对照，筛选出66个药代动力学性质良好的天然小分子化合物，获得66个药代动力学性质良好的天然小分子抑制剂，优选出11味中药单味药，2个中药药对甘草-桑白皮和金银花-连翘，以及桑菊饮、桑菊饮合银翘散加减等12个中药处方作为抗击新型冠状病毒的候选方案。结论本研究基于高通量分子对接技术虚拟筛选SARS-CoV-2 3CL水解酶的中药小分子抑制剂及中药，结合网络药理学分析潜在分子机制，为中药抗击新型冠状病毒提供了科学指导与理论依据。