【摘 要】
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目的 运用生物学信息方法分析鸟分枝杆菌相关致病基因MAV2054编码蛋白的生物学特征. 方法 从NCBI中检索鸟分枝杆菌MAV2054蛋白基因信息.使用序列的fasta格式用在线软件预测MA
【机 构】
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大理大学基础医学院医学微生物与免疫学教研室,云南大理671000
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目的 运用生物学信息方法分析鸟分枝杆菌相关致病基因MAV2054编码蛋白的生物学特征. 方法 从NCBI中检索鸟分枝杆菌MAV2054蛋白基因信息.使用序列的fasta格式用在线软件预测MAV2054蛋白理化性质、跨膜区、信号肽、二级和三级结构、T细胞和B细胞表位、亚细胞定位,使用MEGA软件构建系统发育树. 结果 MAV2054蛋白基因全长924个碱基,共307个氨基酸,其中亮氨酸(Leu)含量高达11.4％,丙氨酸(Ala) 9.1％、苏氨酸(Thr) 9.1％、无吡咯赖氨酸(Pyl)和硒半胱氨酸(Sec).该蛋白拥有两个跨膜区(由内向外和由外向内),可能无信号肽.MAV2054蛋白含有3个T细胞表位和28个B细胞表位.二级结构中α螺旋占45％,β折叠15％.三级结构构建成功,可信度96.7％.系统进化树结果显示MAV2054蛋白与MAV2941编码蛋白归一簇,相似度43％. 结论 生物信息学分析MAV2054蛋白性质较稳定,含有多个T细胞和B细胞优势抗原表位,可作为鸟分枝杆菌肽疫苗研发新靶标.
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