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司马贞撰写《史记索隐》的初衷是要续补《史记》，但是由于种种原因，这项工程没能完成，进而改为注解，因而《史记索隐》中也常常体现司马贞补《史记》的残留痕迹。古今学者对司马贞及其著作的研究多集中在“三家注”之一的《史记索隐》上，对司马贞的补史工作或是视而不见，或是只作只言片语的讨论。然而，明确司马贞续补《史记》的自觉意识和批判精神在《索隐》中的体现，是我们做好《史记索隐》研究工作必不可少的一环。