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摘要： 分别从生长于云南楚雄的核桃根、茎、叶中分离内生放线菌，并对分离菌株进行纯化、保存。通过对分离菌株生长特性、形态观察、分子分类等研究，对菌株进行初步鉴定与抗菌活性研究。结果表明，共分离得到42株内生放线菌，其中从根中分离11株、从茎中分离12株、从叶中分离19株，分离菌株均属于链霉菌属。试验内生放线菌菌株SA8对拟盘多毛孢、链格孢、德氏孺孢、灰葡萄孢、疫霉这5种病原菌均有抑菌作用。
关键词： 核桃；内生放线菌；分离；鉴定；抗菌活性
中图分类号：S664.101 文献标志码：A
文章编号：1002-1302（2015）08-0106-04
放线菌（actinomycete）是抗生素的主要产生菌，目前从微生物中发现的8 000多种活性物质中，有近70%是放线菌产生的，目前放线菌已被广泛用于工业、农业和医学领域 [1-2]。如我国研制开发的井冈霉素、多效霉素农用链霉素等生物农药已经大量使用，产生了较大的社会、经济和生态效益 [3]。植物内生菌（plant endophyte）作为一类重要的微生物资源具有重要的理论研究价值和开发潜力，其中植物内生放线菌具有独特的代谢和遗传机制，在植物病害生物防治中有广阔的应用开发前景，现已成为国内外学者研究的热点 [4-5]。内生放线菌可用于控制植物病害，已分离得到的一些内生放线菌菌株，多数对引起植物病害的真菌具有抗菌作用。从小麦中分离到的38株内生放线菌，大部分对小麦病原菌Gaeumannomyces graminis var. tritici表现出抑制活性 [6]。从1株野生的烈香杜鹃中分离到的Streptomyces sp. R-5，对杜鹃花属植物的2种主要的病原真菌Phytophthora cinnamomi、Pestalotiopsis sydowiana具有拮抗活性，对革兰氏阳性细菌、酵母菌和丝状真菌也具有广泛的抗菌性，可产生actinomycin X2和fungichromin [7-8]。从香蕉中分离得到的Streptomyces sp. S96可增强植物对香蕉镰刀菌萎蔫病的抗性，促进植物的生长 [9]。此外，从植物内生放线菌中筛选的生防菌及其分泌的抗菌素在植物各种病害中均取得了良好的防治效果 [10]。地球上植物种类繁多，从丰富的植物宿主中寻找新内生菌菌种资源的机率较高 [11]。而植物内生放线菌可作为进一步筛选生物活性物质的种质资源，因此，植物内生放线菌研究有着广阔的发展前景和重要的研究意义。
核桃（Juglans regia）是我国栽培历史悠久的经济树种之一，在全国20多个省（市、区）均有栽培。在云南省楚雄，核桃是极为重要的经济作物，2001年大姚被国家林业局授予“中国核桃之乡”。但随着核桃的大面积种植，核桃病害的危害日趋严重，如由真菌引起的枝枯病、腐烂病、溃疡病等对核桃品质和产量产生了较大影响。因此，通过对生长于云南楚雄的核桃内生放线菌进行研究，旨在为核桃内放线菌资源分析、防治核桃病害提供一定的理论依据，有助于核桃产业健康发展。
1 材料与方法
1.1 试验材料
试验材料为取自楚雄不同地区无病斑、无虫害的健康核桃树的根、茎、叶。
1.2 分离培养基
内生菌分离培养基：TWYE培养基（0.25 g yeast extract，0.5 g KH2PO4，1 L蒸馏水，15 g 琼脂），琥珀酸钠培养基（2 g琥珀酸钠，0.3 g KH2PO4，0.1 g MgSO4·7H2O，1 g CaCO3，001 g FeSO4·7H2O，15 g 琼脂，1 L ddH2O，pH值7.2），苹果酸钠培养基（0.6 g苹果酸钠，0.2 g MgSO4·7H2O，0.01 g FeSO4·7H2O，0.6 g CaCO3，0.3 g KH2PO4，0.5 g KNO3，15 g 琼脂，1 L ddH2O，pH值7.2），纤维素培养基（0.5 g纤维素，0.5 g Na2HPO4，3 g yeast tract，0.05 g MgSO4·7H2O，0.01 g FeSO4·7H2O，3 g KNO3，2 g CaCO3，15 g琼脂，1 L ddH2O），ISP5培养基[1 g L-天门冬氨酸，10 g甘油，1 g K2HPO4，1 mL 微量盐（0.1 g FeSO4·7H2O，0.12 g MnSO4，0.1 g ZnSO4，100 mL 蒸馏水），pH值7.0～7.4，20 g琼脂，1 L蒸馏水]。
使用高氏Ⅰ号培养基（20 g可溶性淀粉，1 g KNO3，0.5 g NaCl，0.5 g K2HPO4，0.5 g MgSO4，0.01 g FeSO4，pH值7.0～7.4，20.0 g琼脂，1 L蒸馏水）富集培养。
1.3 指示菌
拟盘多毛孢（Pestalotiopsis spp.）、链格孢（Alternaria spp.）、德氏孺孢（Drechslera spp.）、灰葡萄孢（Botrytis cinerea）、疫霉（Phytophthora spp.）。
1.4 菌种分离
分别选取不同核桃组织，冲洗干净后，将根、茎、叶分别进行表面消毒（0.01% Tween 20 浸泡1 min→ 70%乙醇溶液处理2 min→无菌去离子水洗4～5次→有效氯含量为5%的次氯酸钠浸泡5 min→硫代硫酸钠溶液浸泡10 min→无菌去离子水洗4～5次）。取0.5 mL最后一遍清洗植物样品的水涂布于TSA 固体培养基（15 g酪蛋白胨，5 g大豆蛋白胨，5 g NaCl，15 g琼脂，pH值7.2）上，28 ℃条件下培养1周，检测表面消毒效果。将表面消毒的植物组织打碎，均匀接种于分离培养基，置于28 ℃恒温培养箱中培养1～3周，至组织块上出现内生放线菌菌丝后，挑取菌丝用TWYE培养基进行划线纯化，纯化的菌株移入高氏Ⅰ号 [12]斜面中培养后保存。 1.5 DNA提取和16S rRNA 基因扩增
组DNA采用螯合树脂法（chelex）提取分离放线菌菌株DNA [13-15]。扩增引物由上海生工生物工程技术服务有限公司合成。 PA：5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′；PB：5′-TTAAGGTGATCCAGCCGCA-3′。PCR扩增条件：95 ℃预变性5 min；95 ℃变性1 min，54 ℃ 退火1 min，72 ℃延伸3 min，30个循环；72 ℃延伸10 min。
1.6 扩增产物测序
16S rRNA基因扩增产物经纯化后，送往上海生工生物工程技术服务有限公司，用ABI 3730 DNA Sequencer （applied biosystems）测序。测序引物：P1：5′-CGGAATTATTGGGCGTA-3′； P2：5′-CCTTACCTGGGCTTGACAT-3′；P3：5′-CCTTACCTGGGCTTGACAT-3′。
1.7 16S rRNA系统发育分析
将测得的序列利用Eztaxon Server 2.1 在GenBank数据库中进行相似性搜索，选取同源性高的典型菌株的16S rRNA基因序列作为参比对象。采用MEGA 4软件进行多序列比对及系统发育分析。采用邻接法和最大似然法构建系统进化树。
1.8 内生放线菌的形态特征
采用搭片法观察分离菌株显微形态特征 [14]，根据菌株菌落和菌丝形态特征排除重复菌株。
1.9 分离菌株生长特性试验
1.9.1 生长温度
使用高氏Ⅰ号平板，接种后分别在4 ℃、10 ℃、15 ℃、室温（约22 ℃）、28 ℃、37 ℃、45 ℃、55 ℃条件下培养，每2 d观察记录1次，连续培养1周，重复1次。
1.9.2 生长盐浓度
别配制含0、3%、5%、7%、10%、15%NaCl的高氏Ⅰ号固体培养基，接种后在28 ℃条件下培养，每2 d观察记录1次，连续培养1周，重复1次。
1.9.3 生长pH值
使用高氏Ⅰ号培养基加入相应缓冲剂，分别配制pH值4.0～5.0、6.0～8.0、9.0～10.0、11的液体培养基，接种后于28 ℃条件下培养，每2 d观察记录1次，连续 培养10 d，重复1次。缓冲液配方：pH值4.0～5.0，0.1 mol/L 柠檬酸- 0.1 mol/L 柠檬酸钠；pH值6.0～8.0，0.1 mol/L KH2PO4 0.1 mol/L NaOH；pH值9.0～10.0，0.1 mol/L NaHCO3 0.1 mol/L Na2CO3；pH值11，0.05 mol/L Na2HPO4 0.1 mol/L NaOH。
1.10 分离菌株的抗菌活性筛选
1.10.1 分离菌株发酵
选取18个放线菌菌株接种于高氏液体培养基中，在28 ℃、200 r/min摇床中培养10 d，发酵液用乙酸乙酯浸提48 h，高速离心，取上清液用旋转蒸发仪蒸干，加入无菌水制成发酵样品。
1.10.2 指示菌的活化及培养 将拟盘多毛孢、链格孢、德氏孺孢、灰葡萄孢和疫霉5种指示菌菌株接种于PDA固体培养基上恒温培养4～6 d，活化，用于抑菌试验。活化好的病原菌接种于PDA 液体培养基，在28 ℃、120 r/min 摇床中培养至对数生长期。
1.10.3 抑菌试验
取200 μL菌液加入PDA培养基制成含菌平板，采用滤纸片法进行抑菌试验，28 ℃恒温培养48 h，测量抑菌圈的直径，以两性霉素溶液40 g/mL为阳性对照。
2 结果与分析
2.1 不同培养基的分离效果
核桃根、茎、叶组织接入5种不同培养基中，共得到42株内生放线菌，其中从叶中分离得到的内生放线菌数量最多，共19株，占分离菌株总数的45.2%；其次为茎，分离到12株，占28.7%；根部分离到的菌株最少，仅为11株，占26.1%（表1）。对核桃不同器官进行内生放线菌分离的结果为：从叶中分离的最多，其次为茎，根中分离的最少。
植物根、茎、叶组织块分别接入5种不同培养基中，在纤维素培养基中分离得到的内生放线菌数量最多，分离到13株；其次是TWYE培养基和苹果酸钠培养基，ISP5培养基分离效果较差。由试验结果可得，5种培养基中，纤维素培养基最适合分离植物内生放线菌，TWYE培养基和苹果酸钠培养基次之，最不适宜分离植物内生放线菌的是ISP5培养基。
2.2 生长温度
在不同温度下，核桃内生放线菌生长的情况不同，所有分离菌株在28 ℃下均可观察到生长现象，而在4 ℃、10 ℃、15 ℃、室温、37 ℃、 45 ℃下仅有部分菌株生长，而在55 ℃条件下分离的菌株均不生长。因此，在28 ℃最适宜下菌株生长，这可能与核桃生长的环境温度为28 ℃左右有关。
2.3 生长盐浓度
核桃内生放线菌分离株在不同NaCl浓度下，生长的情况不同。核桃内生放线菌在含3%、5%、7%NaCl的高氏Ⅰ号培养基上均可观察到生长现象，在含10%、15%NaCl的培养基中则不能观察到生长现象；在不含NaCl的培养基中，所有放线菌分离菌株均生长最为旺盛，所有分离菌株在含3%NaCl的培养基上生长也较好。42个分离菌株中，有2个分离菌株不能在含5%NaCl的培养基上生长，有4个分离菌株不能在含7%NaCl的培养基上生长。菌株RA7和L8号菌耐受的NaCl浓度范围较狭窄，仅可以在3%及以下的NaCl浓度下生长。其次是菌株SA8和菌株R9，仅能在3%、5%NaCl浓度下生长。以上结果表明，核桃内生放线菌生长NaCl浓度范围是3%～7%，在不含NaCl条件下最适合核桃内生放线菌的生长。在一定生长盐浓度范围内，其生长随NaCl浓度升高而受抑制，高盐环境可抑制核桃内生放线菌的生长。 本研究结果表明，核桃内生放线菌数量丰富；核桃不同部位的内生放线菌在数量、类群分布和优势类群方面存在较大差异，这可能与核桃不同部位组织不同，微生态环境不同有密切关系。同时用不同分离培养基分离得到的核桃内生放线菌类群、数量及其优势类群都具有较为明显的差异。这说明不同分离培养基可选择性分离不同的内生放线菌，同时也说明通过进一步改进分离技术有可能获得更多的可培养内生放线菌。部分分离菌株对多种常见植物病原真菌具有拮抗活性，分离自核桃茎的内生放线菌菌株SA8对本研究中检测的5种指示菌均具有明显的拮抗活性，在植物病害的生物防治方面具有较大的开发潜力。菌株SA8的16S rRNA基因序列分析结果表明，其与有效发表种Streptomyces yokosukanensis NRRL B-3353T的关系最近，序列同源性为98.65%，其具体分类地位还须要进一步研究。
[JP3]植物内生放线菌在新型农用抗生素的研究方面具有较大开发潜力，本研究结果表明，从核桃内生放线菌分离株中筛选到具有开发潜力的活性菌株的概率较高。因此，内生放线菌资源可作为生防菌株筛选和新生物活性物质研究的重要微生物资源。
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关键词： 核桃；内生放线菌；分离；鉴定；抗菌活性
中图分类号：S664.101 文献标志码：A
文章编号：1002-1302（2015）08-0106-04
放线菌（actinomycete）是抗生素的主要产生菌，目前从微生物中发现的8 000多种活性物质中，有近70%是放线菌产生的，目前放线菌已被广泛用于工业、农业和医学领域 [1-2]。如我国研制开发的井冈霉素、多效霉素农用链霉素等生物农药已经大量使用，产生了较大的社会、经济和生态效益 [3]。植物内生菌（plant endophyte）作为一类重要的微生物资源具有重要的理论研究价值和开发潜力，其中植物内生放线菌具有独特的代谢和遗传机制，在植物病害生物防治中有广阔的应用开发前景，现已成为国内外学者研究的热点 [4-5]。内生放线菌可用于控制植物病害，已分离得到的一些内生放线菌菌株，多数对引起植物病害的真菌具有抗菌作用。从小麦中分离到的38株内生放线菌，大部分对小麦病原菌Gaeumannomyces graminis var. tritici表现出抑制活性 [6]。从1株野生的烈香杜鹃中分离到的Streptomyces sp. R-5，对杜鹃花属植物的2种主要的病原真菌Phytophthora cinnamomi、Pestalotiopsis sydowiana具有拮抗活性，对革兰氏阳性细菌、酵母菌和丝状真菌也具有广泛的抗菌性，可产生actinomycin X2和fungichromin [7-8]。从香蕉中分离得到的Streptomyces sp. S96可增强植物对香蕉镰刀菌萎蔫病的抗性，促进植物的生长 [9]。此外，从植物内生放线菌中筛选的生防菌及其分泌的抗菌素在植物各种病害中均取得了良好的防治效果 [10]。地球上植物种类繁多，从丰富的植物宿主中寻找新内生菌菌种资源的机率较高 [11]。而植物内生放线菌可作为进一步筛选生物活性物质的种质资源，因此，植物内生放线菌研究有着广阔的发展前景和重要的研究意义。
核桃（Juglans regia）是我国栽培历史悠久的经济树种之一，在全国20多个省（市、区）均有栽培。在云南省楚雄，核桃是极为重要的经济作物，2001年大姚被国家林业局授予“中国核桃之乡”。但随着核桃的大面积种植，核桃病害的危害日趋严重，如由真菌引起的枝枯病、腐烂病、溃疡病等对核桃品质和产量产生了较大影响。因此，通过对生长于云南楚雄的核桃内生放线菌进行研究，旨在为核桃内放线菌资源分析、防治核桃病害提供一定的理论依据，有助于核桃产业健康发展。
1 材料与方法
1.1 试验材料
试验材料为取自楚雄不同地区无病斑、无虫害的健康核桃树的根、茎、叶。
1.2 分离培养基
内生菌分离培养基：TWYE培养基（0.25 g yeast extract，0.5 g KH2PO4，1 L蒸馏水，15 g 琼脂），琥珀酸钠培养基（2 g琥珀酸钠，0.3 g KH2PO4，0.1 g MgSO4·7H2O，1 g CaCO3，001 g FeSO4·7H2O，15 g 琼脂，1 L ddH2O，pH值7.2），苹果酸钠培养基（0.6 g苹果酸钠，0.2 g MgSO4·7H2O，0.01 g FeSO4·7H2O，0.6 g CaCO3，0.3 g KH2PO4，0.5 g KNO3，15 g 琼脂，1 L ddH2O，pH值7.2），纤维素培养基（0.5 g纤维素，0.5 g Na2HPO4，3 g yeast tract，0.05 g MgSO4·7H2O，0.01 g FeSO4·7H2O，3 g KNO3，2 g CaCO3，15 g琼脂，1 L ddH2O），ISP5培养基[1 g L-天门冬氨酸，10 g甘油，1 g K2HPO4，1 mL 微量盐（0.1 g FeSO4·7H2O，0.12 g MnSO4，0.1 g ZnSO4，100 mL 蒸馏水），pH值7.0～7.4，20 g琼脂，1 L蒸馏水]。
使用高氏Ⅰ号培养基（20 g可溶性淀粉，1 g KNO3，0.5 g NaCl，0.5 g K2HPO4，0.5 g MgSO4，0.01 g FeSO4，pH值7.0～7.4，20.0 g琼脂，1 L蒸馏水）富集培养。
1.3 指示菌
拟盘多毛孢（Pestalotiopsis spp.）、链格孢（Alternaria spp.）、德氏孺孢（Drechslera spp.）、灰葡萄孢（Botrytis cinerea）、疫霉（Phytophthora spp.）。
1.4 菌种分离
分别选取不同核桃组织，冲洗干净后，将根、茎、叶分别进行表面消毒（0.01% Tween 20 浸泡1 min→ 70%乙醇溶液处理2 min→无菌去离子水洗4～5次→有效氯含量为5%的次氯酸钠浸泡5 min→硫代硫酸钠溶液浸泡10 min→无菌去离子水洗4～5次）。取0.5 mL最后一遍清洗植物样品的水涂布于TSA 固体培养基（15 g酪蛋白胨，5 g大豆蛋白胨，5 g NaCl，15 g琼脂，pH值7.2）上，28 ℃条件下培养1周，检测表面消毒效果。将表面消毒的植物组织打碎，均匀接种于分离培养基，置于28 ℃恒温培养箱中培养1～3周，至组织块上出现内生放线菌菌丝后，挑取菌丝用TWYE培养基进行划线纯化，纯化的菌株移入高氏Ⅰ号 [12]斜面中培养后保存。 1.5 DNA提取和16S rRNA 基因扩增
组DNA采用螯合树脂法（chelex）提取分离放线菌菌株DNA [13-15]。扩增引物由上海生工生物工程技术服务有限公司合成。 PA：5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′；PB：5′-TTAAGGTGATCCAGCCGCA-3′。PCR扩增条件：95 ℃预变性5 min；95 ℃变性1 min，54 ℃ 退火1 min，72 ℃延伸3 min，30个循环；72 ℃延伸10 min。
1.6 扩增产物测序
16S rRNA基因扩增产物经纯化后，送往上海生工生物工程技术服务有限公司，用ABI 3730 DNA Sequencer （applied biosystems）测序。测序引物：P1：5′-CGGAATTATTGGGCGTA-3′； P2：5′-CCTTACCTGGGCTTGACAT-3′；P3：5′-CCTTACCTGGGCTTGACAT-3′。
1.7 16S rRNA系统发育分析
将测得的序列利用Eztaxon Server 2.1 在GenBank数据库中进行相似性搜索，选取同源性高的典型菌株的16S rRNA基因序列作为参比对象。采用MEGA 4软件进行多序列比对及系统发育分析。采用邻接法和最大似然法构建系统进化树。
1.8 内生放线菌的形态特征
采用搭片法观察分离菌株显微形态特征 [14]，根据菌株菌落和菌丝形态特征排除重复菌株。
1.9 分离菌株生长特性试验
1.9.1 生长温度
使用高氏Ⅰ号平板，接种后分别在4 ℃、10 ℃、15 ℃、室温（约22 ℃）、28 ℃、37 ℃、45 ℃、55 ℃条件下培养，每2 d观察记录1次，连续培养1周，重复1次。
1.9.2 生长盐浓度
别配制含0、3%、5%、7%、10%、15%NaCl的高氏Ⅰ号固体培养基，接种后在28 ℃条件下培养，每2 d观察记录1次，连续培养1周，重复1次。
1.9.3 生长pH值
使用高氏Ⅰ号培养基加入相应缓冲剂，分别配制pH值4.0～5.0、6.0～8.0、9.0～10.0、11的液体培养基，接种后于28 ℃条件下培养，每2 d观察记录1次，连续 培养10 d，重复1次。缓冲液配方：pH值4.0～5.0，0.1 mol/L 柠檬酸- 0.1 mol/L 柠檬酸钠；pH值6.0～8.0，0.1 mol/L KH2PO4 0.1 mol/L NaOH；pH值9.0～10.0，0.1 mol/L NaHCO3 0.1 mol/L Na2CO3；pH值11，0.05 mol/L Na2HPO4 0.1 mol/L NaOH。
1.10 分离菌株的抗菌活性筛选
1.10.1 分离菌株发酵
选取18个放线菌菌株接种于高氏液体培养基中，在28 ℃、200 r/min摇床中培养10 d，发酵液用乙酸乙酯浸提48 h，高速离心，取上清液用旋转蒸发仪蒸干，加入无菌水制成发酵样品。
1.10.2 指示菌的活化及培养 将拟盘多毛孢、链格孢、德氏孺孢、灰葡萄孢和疫霉5种指示菌菌株接种于PDA固体培养基上恒温培养4～6 d，活化，用于抑菌试验。活化好的病原菌接种于PDA 液体培养基，在28 ℃、120 r/min 摇床中培养至对数生长期。
1.10.3 抑菌试验
取200 μL菌液加入PDA培养基制成含菌平板，采用滤纸片法进行抑菌试验，28 ℃恒温培养48 h，测量抑菌圈的直径，以两性霉素溶液40 g/mL为阳性对照。
2 结果与分析
2.1 不同培养基的分离效果
核桃根、茎、叶组织接入5种不同培养基中，共得到42株内生放线菌，其中从叶中分离得到的内生放线菌数量最多，共19株，占分离菌株总数的45.2%；其次为茎，分离到12株，占28.7%；根部分离到的菌株最少，仅为11株，占26.1%（表1）。对核桃不同器官进行内生放线菌分离的结果为：从叶中分离的最多，其次为茎，根中分离的最少。
植物根、茎、叶组织块分别接入5种不同培养基中，在纤维素培养基中分离得到的内生放线菌数量最多，分离到13株；其次是TWYE培养基和苹果酸钠培养基，ISP5培养基分离效果较差。由试验结果可得，5种培养基中，纤维素培养基最适合分离植物内生放线菌，TWYE培养基和苹果酸钠培养基次之，最不适宜分离植物内生放线菌的是ISP5培养基。
2.2 生长温度
在不同温度下，核桃内生放线菌生长的情况不同，所有分离菌株在28 ℃下均可观察到生长现象，而在4 ℃、10 ℃、15 ℃、室温、37 ℃、 45 ℃下仅有部分菌株生长，而在55 ℃条件下分离的菌株均不生长。因此，在28 ℃最适宜下菌株生长，这可能与核桃生长的环境温度为28 ℃左右有关。
2.3 生长盐浓度
核桃内生放线菌分离株在不同NaCl浓度下，生长的情况不同。核桃内生放线菌在含3%、5%、7%NaCl的高氏Ⅰ号培养基上均可观察到生长现象，在含10%、15%NaCl的培养基中则不能观察到生长现象；在不含NaCl的培养基中，所有放线菌分离菌株均生长最为旺盛，所有分离菌株在含3%NaCl的培养基上生长也较好。42个分离菌株中，有2个分离菌株不能在含5%NaCl的培养基上生长，有4个分离菌株不能在含7%NaCl的培养基上生长。菌株RA7和L8号菌耐受的NaCl浓度范围较狭窄，仅可以在3%及以下的NaCl浓度下生长。其次是菌株SA8和菌株R9，仅能在3%、5%NaCl浓度下生长。以上结果表明，核桃内生放线菌生长NaCl浓度范围是3%～7%，在不含NaCl条件下最适合核桃内生放线菌的生长。在一定生长盐浓度范围内，其生长随NaCl浓度升高而受抑制，高盐环境可抑制核桃内生放线菌的生长。 本研究结果表明，核桃内生放线菌数量丰富；核桃不同部位的内生放线菌在数量、类群分布和优势类群方面存在较大差异，这可能与核桃不同部位组织不同，微生态环境不同有密切关系。同时用不同分离培养基分离得到的核桃内生放线菌类群、数量及其优势类群都具有较为明显的差异。这说明不同分离培养基可选择性分离不同的内生放线菌，同时也说明通过进一步改进分离技术有可能获得更多的可培养内生放线菌。部分分离菌株对多种常见植物病原真菌具有拮抗活性，分离自核桃茎的内生放线菌菌株SA8对本研究中检测的5种指示菌均具有明显的拮抗活性，在植物病害的生物防治方面具有较大的开发潜力。菌株SA8的16S rRNA基因序列分析结果表明，其与有效发表种Streptomyces yokosukanensis NRRL B-3353T的关系最近，序列同源性为98.65%，其具体分类地位还须要进一步研究。
[JP3]植物内生放线菌在新型农用抗生素的研究方面具有较大开发潜力，本研究结果表明，从核桃内生放线菌分离株中筛选到具有开发潜力的活性菌株的概率较高。因此，内生放线菌资源可作为生防菌株筛选和新生物活性物质研究的重要微生物资源。
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