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丛枝菌根（arbuscular mycorrhiza，AM）真菌是一类专性共生多核生物，至今尚未获得纯培养，与植物根系共生后才能完成其生活史。该类真菌无性繁殖，具有独特的遗传特性，属于真菌界球囊菌门（Glomeromycota），共有200余种。研究发现AM真菌种群间以及种群内，甚至单一孢子内都存在大量基因变异，表明该类真菌具有丰富的遗传多样性。本文总结了近年来有关AM真菌遗传多样性方面的研究进展，并讨论了存在的问题。