【摘 要】
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植物中编码类黄酮、木质素生物合成的关键酶,4-香豆酸-辅酶A连接酶(4CL)的基因通常是家族基因。本研究通过生物信息学分析,从克里曼丁柑橘(Citrus clementina)基因组数据库中
【机 构】
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中国农业科学院/西南大学柑桔研究所国家柑桔工程技术研究中心;
【基金项目】
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中央高校基本业务费项目(XDJK2016C143);国家现代农业产业技术体系建设专项资金项目(CARS-26);重庆市社会事业与民生保障科技创新专项项目(cstc2016shms-ztzx80002,cstc2016shms-ztzx80004);重庆市现代山地特色高效农业技术体系创新团队建设计划项目;国家重点研发计划项目(2018YFD1000101);西南大学双一流学科建设项目
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植物中编码类黄酮、木质素生物合成的关键酶,4-香豆酸-辅酶A连接酶(4CL)的基因通常是家族基因。本研究通过生物信息学分析,从克里曼丁柑橘(Citrus clementina)基因组数据库中筛选出了一些拟为(4CL)基因的序列。通过对其蛋白结构进行分析,发现其中仅有3个基因具有典型的4CL家族基因的特性。聚类分析结果表明柑橘Cit4CL家族的三个基因可以分为Class I和Class II两类。利用荧光定量PCR(qPCR)对北京柠檬不同组织和果实发育过程中4CL的表达进行了分析,发现4CL各个成员在不同的组织及果实发育时期的表达存在明显的差异,其中Cit4CL1基因的表达水平与类黄酮含量呈显著的正相关,说明该基因对调控柑橘类黄酮的生物合成具有重要作用。Cit4CL2和CitCL3基因的表达与类黄酮的含量没有相关性,但其表达的组织特异性和木质素生物合成较为活跃的组织明显相关,表明该两个基因是与木质素生物合成相关的基因。
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