【摘 要】
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提出了一种基于频繁子树挖掘策略说我DNA重复序列识别方法.绕开了传统的序列比对方式,将序列按照后缀树结构方式进行组织,再对后缀树形式做了约减改进,使其更加适合子树挖掘
【基金项目】
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国家自然科学基金项目（30671639）, 江苏省自然科学基金项目（BK2009393）, 江苏省青蓝工程学术带头人项目
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提出了一种基于频繁子树挖掘策略说我DNA重复序列识别方法.绕开了传统的序列比对方式,将序列按照后缀树结构方式进行组织,再对后缀树形式做了约减改进,使其更加适合子树挖掘操作,最后利用频繁子树挖掘的方法对其进行学习.算法可以直接识别出满足设定阈值的重复序列,避免了由短重复体拼接所造成的时间浪费,设计的＂二次识别技术＂使得算法对模糊重复体也有着很好的识别效果,提高了识别完整度.实验证明：算法在识别效率性能方面较升,尤其当识别较长重复体时,优势体现的更为明显,同时在识别完整度方面也高度可比.
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