博卡病毒2基因突变对蛋白三级结构及其进化关系的影响

来源 :中华实验和临床病毒学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:milan_27
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的

了解人类博卡病毒2(HBoV2)基因突变对重要功能蛋白三级结够及其进化关系的影响。

方法

对瑞安地区205份小儿腹泻患者粪便标本进行HBoV2基因筛选。选取阳性样本,采用巢式PCR方法对HBoV2全基因组扩增。通过Swiss-PdbViewer对预测蛋白结构进行分析,并采用MEGA5.1软件进行进化树分析。

结果

瑞安地区HBoV2阳性检出率为5.36%(11/205)。HBoV2全基因组经过拼接后为5196 bases,与参考基因组同源性达到99.79%。其中,NP1基因未发生突变,NS1、VP1和VP2基因存在有义突变。NS1测序组和对照组蛋白表面突变氨基酸疏水性质发生变化;VP1测序组和对照组蛋白空间结构和分子内部氢键分布发生变化。系统进化树分析显示,HBoV2中NS1突变造成亲缘关系变化,突变后NS1有向HBoV4演化趋势。

结论

研究证明瑞安地区小儿腹泻患者存在HBoV2感染,且阳性样本中HBoV2基因发生突变。有义突变造成重要蛋白空间结构和亲缘关系变化。这些结果对研究HBoV2病毒突变后的进化方向奠定基础。

其他文献
期刊
目的探讨血清midkine(MK)能否鉴别甲状腺结节良恶性及131I治疗前血清MK能否预测DTC患者是否存在转移灶。方法在鉴别甲状腺结节良恶性的研究中,有162例患者(其中DTC 70例、良性甲状腺结节92例)入组,同时有75名健康者作为对照。通过ROC曲线研究术前MK和Tg水平对甲状腺结节良恶性的鉴别诊断价值。在预测是否存在转移灶的研究中,有214例DTC患者入组。通过ROC曲线研究131I治疗
目的诊断刚入境以色列患者是否患狂犬病,并确定其传染来源。方法对患者唾液及脑脊液标本进行RT-PCR检测,检测阳性标本进行病毒N基因序列测定,并通过种系发生分析确定毒株来源。结果患者唾液标本为狂犬病病毒阳性,病毒N基因序列种系发生分析显示,患者感染病毒株与印度野生动物狂犬病毒亲缘关系最近。结论该以色列患者为我国首例实验室确诊的狂犬病输入病例,感染来源为印度。
目的探讨基因沉默人乳头瘤病毒(human papillomavirus,HPV)阳性食管鳞癌细胞系EC9706中E7基因后对细胞内基因表达的影响。方法使用RNAi专用逆转录病毒载体构建可干扰HPV18 E7基因的质粒,转入EC9706细胞系,筛选获得稳定表达干扰片段的细胞株。使用Real-time PCR和Western Blot对胞内相关基因和蛋白进行检测,并比较细胞活力差异。结果通过质粒构建与
目的探讨失代偿期乙型肝炎肝硬化患者骨髓间充质干细胞(BMSCs)对自体外周血淋巴细胞增殖的影响及机制。方法从9例失代偿性肝硬化患者骨髓中分离培养MSCs,实验分四组:①BMSCs+淋巴细胞+PHA接触培养组;②BMSCs+淋巴细胞+PHA非接触培养组;③淋巴细胞+PHA阳性对照组;④单独淋巴细胞阴性对照组。流式细胞术检测各组淋巴细胞增殖情况,逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测BMSCs的转化生
目的探讨巨细胞病毒性肝衰竭患者的临床特征及预后。方法回顾性分析总结38例巨细胞病毒性肝衰竭患者的临床资料。结果患者年龄在2个月~75岁,成人12例(31.58%),除外各种诱因后仍有6例发病前为健康成人(15.79%)。临床分型以急性、亚急性为主(76.32%),症状以纳差(60.53%)、发热多见(57.89%),生化指标恶化组患者白蛋白、胆碱酯酶低于改善组,总胆红素高于改善组(P<0.05),
目的研究表达HBsAg的重组质粒pVR-S与表达HBsAg的重组腺病毒rAdV-S在不同免疫策略下的免疫效果。方法使用BALB/c小鼠,在比较电击与肌注两种方法后,分别单独免疫pVR-S和rAdV-S,使用ELISA和Elispot方法分别检测体液免疫和细胞免疫水平;然后采用联合免疫pVR-S和rAdV-S,比较联合免疫与单独免疫对小鼠产生免疫应答的不同影响。结果与肌内注射相比较,电击注射pVR-
目的调查EBV在本地区体检人群中的流行情况。方法应用酶联免疫吸附法检测EBV四种标志性抗体的阳性率并分析各项指标与临床诊断的关联性。结果总共筛查198例EBV受检者,其中EBVCA-IgG阳性率最高,其次是EBNA-IgG和EBEA-IgG,阳性率最低为EBVCA-IgM,本地区未成年人感染EBV高于成年人,秋冬季高于其他季节,病例追踪发现EBVCA-IgG阳性和EBNA-IgG阳性与鼻咽癌密切相
目的获取有免疫原性的戊肝抗原蛋白,探讨其作为诊断试剂的应用价值。方法经密码子优化后人工合成戊型肝炎病毒(HEV) HEV-ORF2(aa 368-607)基因,克隆入表达载体pET43a中,构建重组表达质粒pET43a-HEV并进行原核表达;经阴离子交换纯化后通过Western Blotting和ELISA鉴定该蛋白。结果酶切鉴定及测序结果均显示表达质粒构建正确;SDS-PAGE电泳结果显示该蛋白
期刊