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外源型集群是基于FDI的长三角高新技术产业集群模式的主要属性。长三角高新技术产业外源型集群模式的缺陷具有固有性，突出表现为自主创新能力严重不足，亟待向内源型集群模式转型与过渡，核心路径是提高本土企业在高新技术产业集群中的主导和控制能力，培植和放大高新区在高新技术产业集群升级中的自主创新源功能，加快制度创新。因此，要发展长三角内源型高新技术产业集群，地方政府要敢于成为长三角内源型高新技术产业集群发展制度创新的主体。同时重要思路是要提高本土科技型企业创业景气度及成长性。