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根据社会燃烧理论，温度是衡量系统有序程度的可靠指标，也是系统衰退的决定性因素。基于社会燃烧理论设计了区域创新系统温度测度指标，并根据热力学基本理论构建了系统温度测度模型，测度了中国内地31个省市自治区2009－2013年区域创新系统温度，并将其划分为低、中、高3个温区。结果显示，区域创新系统温度值存在，且不同区域温度值不尽相同；RIS温度值越高，发生衰退的可能性越大；不同区域创新系统引起温度上升的矛盾不同。在此基础上，提出了消除矛盾、降低区域创新系统温度的对策建议。