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防汛防旱信息系统是防汛防旱工作的重要武器,有效提高水情、工情、灾情等信息监测和传输的时效性和准确性,保障水利工程防汛防旱功能充分发挥,目前已广泛应用于各地的防汛防旱工作中。从防汛防旱信息系统的内涵及应用出发,探讨了水管单位在信息系统运行管理工作中存在的管理不规范、安全漏洞和人才匮乏等问题,并从建设规划、管理体制、设备管理、安全管理和人才培养等方面提出了加强防汛防旱信息系统运行管理的思路。