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对音乐的特征表示进行了详细的阐述，详细介绍了乐曲相似性度量方法，并字符串编码方法对音乐特征进行编码，然后使用蛋白质序列局部比对方法对2239首中国乐曲和3960首西方乐曲的音乐库进行大量的检索实验。获取了大量的实验数据，对实验结果进行分析，并取得了较好的检索性能。最后针对音乐检索过程中的每次比对都相互无关的特点，具有可以很好地进行并行化特性，对算法进行并行化，实现在4台高档微机构成的群集上进行了并行检索实验，其检索时间约为串行检索时间的1／4，有很高的加速比。