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为了深入揭示引起樱桃谷鸭短喙与矮小综合征（Short beak and dwarfism syndrome, SBDS）的新型鹅细小病毒（novel goose parvovirus, NGPV）的鹅胚增殖特性及分子特征，对从山东省不同地区采集的三份SBDS典型病例使用9日龄鹅胚进行了病毒分离，并对其全基因组序列及编码蛋白序列进行比对。结果成功分离到三株NGPV，分别为SDHT16、SDJN19和SDLC19。三株病毒均能在鹅胚中稳定传代，但致死鹅胚的时间明显长于经典型GPV。三株NGPV之间基因组的同源性高达98.9%～99.7%，而与经典GPV强毒株的同源性则稍低，为95.2%～96.1%。基于三株NGPV与已发表的NGPV毒株和经典GPV强毒株的编码蛋白比对分析显示，与国内经典GPV强毒株相比，NGPV毒株结构蛋白VP1共产生了16个氨基酸点突变，其中9个氨基酸位点与欧洲的B株相同；非结构蛋白Rep1则产生了12个氨基酸位点突变。与经典GPV LH株的末端倒置重复序列（Inverted terminal repeats, ITR）相比，SDHT16、SDJN19和 SDLC19在ITR的回文区茎部分别多出2个、4个、4个碱基，他们之间ITR的同源性达到98.1%～100.0%，而与LH株的同源性为93.0%～94.0%。本研究结果为今后进一步深入研究NGPV的致病机制奠定了基础。