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目的：探讨以问题为导向教学模式在系统解剖学实验教学中的应用效果。方法：选择2012年9月-2015年6月临床医学专业的64名学生，分为实验组和对照组，各32名学生。对照组采取传统教学模式，实验组则采取以问题为导向教学模式，比较两组学生的考试成绩及问卷调查结果。结果：实验组理论考核、标本考核、技术操作考核、综合能力考核成绩显著优于对照组（P＜0.05）。实验组学生在提高学习兴趣、理论记忆、临床联系能力、疾病分析能力显著优于对照组，（P＜0.05）。结论：以问题为导向教学模式在系统解剖学实验教学中的应用，能够提高学生的考核成绩、学习兴趣、理论记忆、临床联系能力、疾病分析能力，但也存在一些不足。