【摘 要】
：
采用生物信息学方法对茶树(Camellia Sinensis)叶部不同发育阶段(单芽/三叶)转录组中的EST-SSR位点信息进行分析,以期为茶树分子标记辅助育种提供有效的参考。利用SSRFINDER
【机 构】
：
安徽农业大学省部共建茶树生物学与资源利用国家重点实验室,安徽农业大学理学院,
论文部分内容阅读
采用生物信息学方法对茶树(Camellia Sinensis)叶部不同发育阶段(单芽/三叶)转录组中的EST-SSR位点信息进行分析,以期为茶树分子标记辅助育种提供有效的参考。利用SSRFINDER软件,对茶树芽叶转录组的高通量测序获得的97454条Unigenes序列(100.91Mb)进行大通量SSR位点的筛选,共获得36249个SSR位点,分布于27913条Unigenes序列中,其发生频率为28.64%,平均分布密度为1/2.78 kb。在茶树芽叶的转录组序列中共发现962种碱基重复基元,其中占主导的是以(AG/CT)n为主(占总SSRs的23.78%)的二核苷酸重复,占到总SSRs的59.19%,其次是三核苷酸和单核苷酸重复,其占比分别为20.92%和13.13%。茶树芽叶转录组所含不同重复基元SSRs的平均长度,相对全器官转录组较短,其中占比最高的是重复长度为18 bp的中长重复序列,占到总SSRs的23.37%,而大于25 bp的较长序列重复极少。同时对茶树不同器官转录组测序的SSR分布特性进行了分析比较,以期为后续的分子标记开发提供参考。
其他文献
舌诊作为四诊中重要的一环,与疾病的诊疗密切相关,本文总结了近年来肺癌舌象的相关研究,为指导临床提供了一定的依据。
<正>青岛市按照国家、省关于理顺学前教育管理体制和办园体制部署要求,坚持学前教育公益普惠发展方向,完成党政机关、群团组织所办幼儿园脱钩改革。通过改革进一步提高办园质
<正> 一、交际教学法的理念信息差(information gap)是交际活动的前提条件之一。没有信息差就没有交际的需要;但是信息差并不等于交际活动,只有把信息差与信息传递(informati
非编码RNA能够调控基因表达、参与表观遗传修饰,细胞分化、增殖、凋亡等多种生命活动。非编码RNA在癌症发生、癌细胞浸润和远端转移等过程中也扮演着重要角色。通过介导基因
近年来关于认识对象的探讨中,有两种不同的观点。一种观点认为,认识对象只能是客体——人化自然部分,而不是整个物质存在。因而认为客体是认识论范畴,而物质(存在)则只是本
【正】 《电影文学浅谈》系统地讲解了电影文学创作的基础知识。全书共分十二节。第一节是电影和电影文学的诞生与发展;第二节至第七节是有关的基础知识:电影
闽江河口湿地是我国东南沿海最具代表性的河口湿地之一,芦苇是该地区重要的土著种。本研究在1.6m2尺度内进行网格土壤取样,室内厌氧培养试验,研究了微观尺度芦苇湿地土壤甲烷
<正> 印象整饰是一个人通过一定的方式影响别人形成对自己的印象的过程。近年来,印象整饰日益受到心理学、组织科学的关注,成为一个非常重要的研究变量。本研究以414名企事业
<正>2015中国节博会暨中国国际绿色建筑创新技术高峰论坛建筑节能推广会上,中国建筑科学研究院建筑环境与节能研究院徐伟院长发表演讲,他认为:中国的绿色建筑应向超低能耗方
目的探讨玻璃纤维桩树脂核联合氧化锆全瓷冠修复磨牙的临床效果。方法玻璃纤维桩树脂核联合氧化锆全瓷冠修复磨牙58例,共70颗牙。修复完成3个月至2年,对全部病例进行随访,检