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介绍了4个目前常见的基因产物功能分类体系，第一代功能分类体系GenProtEC、MIPS和KEGG大都是在Monica Riley提出的分类系统的基础上形成的。而正在发展的Gene 0ntology（G0）是第二代功能分类体系，它涵盖了更多生物体基因产物的功能。该文通过对这几个分类系统的比较，阐明各自的特点，说明其存在的问题。