人类炎症、肿瘤相关1-磷酸神经酰胺转运蛋白的生物信息学分析

来源 :基因组学与应用生物学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:scnbyfy
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
人类1-磷酸神经酰胺转运蛋白(ceramide-l-phosphate transfer protein,CPTP)能在细胞内膜间运输1-磷酸神经酰胺(ceramide-1-phosphate,C1P).为深入研究人类CPTP的功能,本研究通过STRING、Coexpedia、Metascape等在线生物信息学分析工具,分析人类CPTP蛋白的潜在相互作用蛋白、共表达蛋白及其在肿瘤发生发展中的作用.结果表明,人类CPTP蛋白可能参与磷酸酯水解酶活性、膜脂代谢及多种肿瘤发生发展等过程.ceRNA调控分析结果表明多种miRNA、lncRNA可相互作用并调控人类CPTP的表达.本研究结果为进一步研究人类CPTP的功能及调控机制提供了重要的参考.
其他文献
GINS2在多种侵袭性肿瘤中上调,然而,其在非小细胞肺癌(NSCLC)中的作用及功能仍有待阐明.本研究主要对GINS2在非小细胞肺癌中的作用及功能进行分析,通过肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库分析发现,GINS2在NSCLC中显著上调.为了研究GINS2在NSCLC细胞中的作用及其功能,首先,采用小干扰RNA技术设计了该基因的siRNA,以此来沉默GINS2的mRNA,细胞水平转染后,该基因在非小细胞肺癌细胞系NCI-H292和A549中的表达降低;随后,采用实时细胞分析仪(real time cell
为构建脂肪酸结合蛋白5 (FABP5)突变体的原核表达体系,评价突变体蛋白质体外抗前列腺癌细胞的活性.利用定点突变技术,突变FABP5蛋白脂肪酸结合的3个关键位点,并构建原核表达体系,对重组蛋白质进行原核表达、分离纯化.通过细胞毒性、细胞划痕和细胞侵袭试验,评价重组FABP5突变体蛋白质对前列腺癌细胞22RV1和PC3增殖、迁移和侵袭的影响.结果 显示定点突变后的DNA与表达载体pQE32连接并转入大肠杆菌(Escherichia coli) BL21(DE3),经序列测定正确,构建了重组表达工程菌,并诱
为探讨青蒿琥酯(artesunate,ASN)单独或联合头孢菌素类药物对多重耐药(multidrug-resistant,MDR)肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae)的抗菌活性.本研究收集2018年长沙市中心医院临床分离的多重耐药肺炎克雷伯菌菌株32株.分为单独用药组:青蒿琥酯(ASN)组、头孢曲松钠(CRO)/头孢他啶(CAZ)组和联合应用组.采用细菌动态生长曲线法观察青蒿琥酯联合头孢菌素类药物对多重耐药肺炎克雷伯菌的生长影响;采用微量肉汤稀释法检测青蒿琥酯单独或联合头孢菌素类药物
为探究白花蛇舌草提取物对人胃癌MKN-45细胞凋亡的影响.用不同浓度的白花蛇舌草提取物处理MKN-45细胞,然后在光学显微镜和激光共聚焦显微镜下观察数量和形态.流式细胞仪检测细胞凋亡率,RT-qPCR和Western Blot检测凋亡相关基因Bax和Bcl-2的mRNA和蛋白表达水平.结果表明,不同浓度的白花蛇舌草提取物处理48 h后,在显微镜下观察到细胞体积缩小、细胞核裂解和染色质形态变化.细胞凋亡率随着药物浓度的增加而增加,用30 μg/mL白花蛇舌草提取物处理后细胞凋亡率达到23.6%,Bax基因表
microRNAs (miRNAs)是一类功能性非编码RNA,在多种生物过程中具有重要作用.然而,miRNA的表达模式、调控网络以及参与肝纤维化的miRNA仍有待阐明.为了探讨与肝纤维化相关的miRNA及其靶基因的功能,为临床肝纤维化治疗提供理论依据,本研究前期已采用胆管结扎法(BDL)建立大鼠胆汁淤积性肝纤维化模型.从大鼠肝脏中提取总RNA,应用基因芯片技术对胆汁淤积性肝纤维化肝组织中miRNA和mRNA表达谱进行综合分析;结合生物信息方法分析在胆汁淤积性肝纤维化中差异表达miRNA可能的靶基因;实时荧
高血压(hypertension,high blood pressure)是动脉血压持续偏高的慢性疾病;若血压持续超过130/80或140/90 mmHg(收缩压/舒张压),有可能是高血压.高血压可分为原发性高血压和继发性高血压,其中有90%~95%为原发性高血压,5%~10%是继发性高血压.随着人们对心血管病多重危险因素的作用以及心、脑、肾靶器官保护的认识不断深入,对高血压的形成机理、病理生理以及诊断标准有了新的认识,本文系统总结了高血压的形成机理和病理生理,提出了根据患者的具体情况判断最合适的血压范围
黏多糖贮积症(mucopolysaccharidosis,MPS)是一种遗传代谢病.人IDUA基因编码的α-L-艾杜糖苷酶(α-L-iduronidase,IDUA)功能异常是导致Ⅰ型MPS的主要病因.本研究拟构建特异性靶向小鼠Idua基因的CRISPR/Cas9编辑系统,用以模拟人IDUA基因突变,为建立精准模拟Ⅰ型MPS的细胞模型和动物模型提供高效基因编辑系统.本研究筛查了人类IDUA基因的致病突变,并将候选突变位点定位于小鼠Idua基因上,作为拟突变位点.然后通过sgRNA的设计、表达质粒构建、转染
中风已经成为全世界最常见的死亡原因.中风在西方是第三大死因,仅次于心脏病和癌症,并占全球10%的死因.中风发病率从40岁开始成指数增加,病因与年龄、生活方式有关.预防、治疗和护理康复是对中风的发生与发展的三个关键方面.本文系统地论述了中风的预防手段和措施,总结了不同类型中风的治疗对策,阐明了中风后的护理和复健以及预后,以期为护理人员以及公众提供中风的预防知识、治疗对策和康复管理.
本文系统地分析了糖尿病与胰岛素的关系以及胰岛素与血糖的关系,阐明了糖尿病的形成机理,介绍了美国、中国以及WHO的糖尿病临床诊断标准,以期提高和加深公众对糖尿病的认识和了解,有助于全球社会有效地控制和预防糖尿病.
本研究旨在探讨华蟾素诱导人胃癌MKN-45细胞凋亡及其机制.分别用终浓度0、60、70、80μg/L的华蟾素作用于人胃癌MKN-45细胞48 h,采用激光共聚焦显微镜观察细胞形态结构,流式细胞术检测细胞凋亡率、线粒体膜电位,RT-qPCR和Western blot分别检测Bax、Bcl-2、Cy tC、Caspase 9和Caspase 3基因表达水平.结果显示,与对照组相比,0、60、70、80μg/L的华蟾素作用人胃癌MKN-45细胞48h,呈现细胞皱缩、细胞核裂解、染色质凝集等形态学变化,早期凋亡细