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在国家对医院科研经费大量投入的背景下，医院对科研经费的精细化、规范化、科学化的管理需求也越来越大。本文通过对X医院科研经费管理模式的剖析，得出大多数公立医院目前科研经费管理的现状；同时对X医院原有的科研经费管理中存在的弊端进行了深入的分析，从而提出引进新科研经费管理系统的必要性和迫切性。文章还对X医院新引进的科研经费管理系统的具体应用模块进行了介绍，总结了这套系统在X医院的应用价值。最后，提出了这套系统在后续应用中需要进一步改进的几点建议。