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采用AFLP分子标记技术，对“甘蔗属复合体”中4个属16个种的69份来自中国和澳大利亚的甘蔗种质资源材料进行系统演化和亲缘关系分析。2对AFLP引物共检测到173个标记，其中172个为多态标记，多态率达99．4％；通过计算Jaccard相似性系数，用UPGMA和PCA法构建了分子系统树和效应图。结果表明：(1)属间亲缘关系中，甘蔗属与芒属较近，与河八王属和蔗茅属较远，而河八王属与蔗茅属较近；(2)甘蔗属内，细茎野生种与其他种关系较远，其中，栽培品种与热带种关系较近，中国种和印度种关系较近，而大茎野生种自聚