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用单克隆抗体技术将沙眼衣原体分为18个血清型,A~K,L1~L3,Ba,Da,Ia和L2a。随着研究的深入,又鉴定出血清变异型D,D^+,I^-和Ga,沙眼衣原体主要外膜蛋白基因的限制性片段多态性分析和序列分析为分辨力高而简便的基因分型方法,与血清分型有较高的符合率,并鉴定出基因变异型Dv,G,Ib,Jv1和Jv2。沙眼衣原体全染色基因分型能提供血清或基因型内的多态性,可作为沙眼衣原体分型研究的辅