【摘 要】
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目的 通过分析细胞表达基因及其相关信号通路的差异等信息,探索MDCK和MDCK-G1细胞株在接种H1N1流感病毒后出现病毒滴度和细胞生长趋势差异的内在生物学特性等原因.方法 通过I
【机 构】
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武汉生物制品研究所有限责任公司病毒性疫苗研究二室,湖北武汉430207;国家联合疫苗工程技术研究中心,湖北武汉430207;中国生物技术股份有限公司,北京100029
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目的 通过分析细胞表达基因及其相关信号通路的差异等信息,探索MDCK和MDCK-G1细胞株在接种H1N1流感病毒后出现病毒滴度和细胞生长趋势差异的内在生物学特性等原因.方法 通过Illumina测序平台对2株细胞进行转录组测序(RNA sequencing,RNA-seq)和测序结果生物信息学分析后,选择了17个差异基因进行实时定量聚合酶链反应(quantitative real-time polymerase chain reaction,qRT-PCR)验证.结果 MDCK 和MDCK-G1细胞差异基因(differentially expressed genes,DEGs)丨log2(FoldChange)丨 ＞0和padj≤0.05总数为2 786个.相比于MDCK细胞,MDCK-G1细胞有967个基因的表达显著上升,1 819个基因的表达显著下降.差异基因通过基因本体(Gene Ontology,GO)数据库富集功能注释和京都基因和基因组数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)进行通路分析发现,2株细胞在免疫调控和细胞生长周期调控上均存在差异,qRT-PCR验证的17个基因中有16个基因的表达趋势与转录组测序结果一致.结论 2株细胞的转录谱存在显著差异.
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3月12日,北京天空阴郁,中午后淅淅沥沥下起了今年的第一场雨。当听到刘绍棠同志去世的消息后,我的心顿时凉了,沉了,悲涛骤涌着绞痛了胸口。怎么可能呢?两个多月前在第五次全
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