芽孢杆菌具有降解有机氮的功能，但在养殖水体等低营养水体中，可能受到影响。为研究低营养水体中有机氮的降解情况，模拟凡纳滨对虾中间培育过程配制低营养水体，分别接种芽孢杆菌NT9和YB3（NT9水体和YB3水体），然后研究水体中微生物的生长与有机氮的降解，并构建数学模型进行分析。结果显示，起始接种量为10 × 105cfu mL-1时，NT9水体总菌量呈下降趋势，平均3.46 ± 2.39 × 105cfu mL-1，YB3水体则上升到25.43 ± 8.84 × 105cfu mL-1，但是均高于未接种的对照水体。NT9水体和YB3水体的有机氮降解率显著高于对照水体（P<0.05），分别提高50.28%和119.41%，降解速率也分别提高65.22%和121.74%。对照水体、NT9水体和YB3水体单位菌量的有机氮降解效率分别为1.238、1.649和1.904 mg L-1，降解模型为y= - 6.40 + 1.39x1+ 1.45x2、y= 2.11 + 8.21x3- 0.64x4- 1.26x1x3- 0.32x2x4和y= 1.73 +6.11x2（x1、x2、x3、x4分别为总菌量、总菌增量、有机氮含量和时间）。研究表明，在低营养水体中接种芽孢杆菌有利于有机氮的降解，但是不同的菌株具有不同的降解模式，能够适应低营养水平、增殖能力较强的菌株，可以更有效促进有机氮的降解，提高降解效率。