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为了发掘中国野生猕猴桃资源抗溃疡病基因,利用Illumina HiSeq测序平台对不同时间接种溃疡病菌的毛花猕猴桃进行mRNA高通量测序.结果 表明,共获得68 731个Unigene,其中有48 414个基因注释到Nr、SwissProt、KEGG和COG/KOG数据库.KOG注释显示,通用功能预测、转录后修饰、蛋白代谢、伴侣蛋白、信号转导机制,翻译、核糖体结构和生物合成所占比例最高;GO注释表明参与生物过程的差异表达基因数目最多,细胞组分和分子功能次之;KEGG通路分析表明差异基因的富集以生物合成和代谢为主.接种后不同时间点共获得63 050个差异表达基因.通过SSR位点分析,从68 731个Unigene中鉴定出13 652个SSRs位点;同时获得了各类型转录因子1 580个;R基因3 727个.本研究结果对猕猴桃抗溃疡病基因发掘和抗溃疡病新品种选育具有重要的理论指导和育种实践意义.