噪声性听力损失大鼠耳蜗miRNA调控网络分析

来源 :现代预防医学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yjyu2012
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目的通过噪声性听力损失(NIHL)耳蜗差异性mi RNA构建的基因调控网络,分析NIHL耳蜗的重要基因及功能,探讨NIHL的损伤机制。方法 6只SPF及SD大鼠通过110 d B SPL(6 h/d、24 d)的高斯白噪声暴露建立NIHL模型,6只SPF及SD大鼠非噪声暴露作对照,噪声暴露后7 d取实验大鼠耳蜗组织进行s RNA深度测序,分析差异性表达的mi RNA,以差异最显著的8个mi RNA依据靶基因数据库Target Scan、mi Randa和mi RDB共同预测的靶基因建立差异性表达mi RNA的靶基因集,结合蛋白互作数据库构建mi RNA调控网络,统计网络中每个基因相连基因的个数,确定相连基因个数大于30的基因作为NIHL大鼠耳蜗的重要基因,通过Gene Cards数据库对重要基因进行功能注释。结果 (1)噪声暴露组大鼠永久性听阈位移水平(PTS)明显高于对照组(秩和检验:Z值-2097,P<0.01);(2)s RNA测序结果显示2组耳蜗差异性mi RNA有148个[|log2(Fold Change)|>1],差异性最显著的8个mi RNA为:rno-mi R-378b、rno-mi R-211-5p、rno-mi R-133b-3p、rno-mi R-29c-3p、rno-let-7c-2-3p、rno-mi R-674-5p、rno-mi R-495、rno-mi R-3068-3p;(3)mi RNA调控网络中的重要基因有11个:VEGFA、TNF、EGFR、FOS、NR3C1、AGT、CREBBP、PTK2、CD44、STAT3、IGF1。结论 NIHL大鼠耳蜗的11个重要基因通过调控细胞增殖与分化、控制细胞凋亡、改善组织细胞营养代谢、介导组织炎性反应以改善和修复耳蜗组织细胞。
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