银屑病性关节炎的致病基因筛选及生物信息学分析

来源 :山东医药 | 被引量 : 0次 | 上传用户：ghost_lovelove

【摘要】

：

目的筛选银屑病性关节炎(PsA)的致病基因,并对致病基因进行生物信息学分析。方法选取美国生物信息技术中心(NCBI)的公共基因芯片数据(编号为GSE61281),通过R编程语言分析PsA

【作者】

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何剑戈夏群吴凯楠杨凯锐贾栋李明昊

【机构】

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中国人民武装警察部队后勤学院,中国人民武装警察部队特色医学中心,中国人民解放军92126部队,天津医科大学,天津中医药大学

【出处】

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山东医药

【发表日期】

：

2019年8期

【关键词】

：

关节炎银屑病寡核苷酸序列分析计算机生物学 arthritis psoriasis oligonucleotide array sequence anal

【基金项目】

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国家自然科学基金资助项目(81572199),天津市应用基础与前沿技术研究计划项目(15JCYBYC50600)

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目的筛选银屑病性关节炎(PsA)的致病基因,并对致病基因进行生物信息学分析。方法选取美国生物信息技术中心(NCBI)的公共基因芯片数据(编号为GSE61281),通过R编程语言分析PsA患者外周血样本和对照组外周血样本的芯片数据,筛选差异表达基因,使用GLAD4U数据库与ToppGene数据库对差异表达基因进行优化和补充,筛选出PsA的致病基因。用DAVID和KOBAS3.0在线工具对致病基因进行富集分析,String数据库构建PsA致病基因的PPI网络,筛选PsA发病过程中的重点基因、主要生物过程及信号

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