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防范高校科研经费腐败风险的核心在于制约项目负责人的经费使用决策,把握科研经费管理和使用流程上的关键点。在经费预算环节上贯彻智力劳动的有偿性原则;在经费执行环节上实施科研项目档案化管理方式;在经费结余环节上通过绩效奖励实施逆向激励机制。三个关键点辩证统一,逆向激励机制是处理结余经费的有效办法,也可成为间接考察科研劳动投入强度和时间的理论依据。通过科研项目档案化管理的三位一体来制约项目负责人的经费使用决策,防范高校科研经费腐败风险。