基于生物信息学分析胃癌中RUNX1表达及其临床意义

来源 :中国普外基础与临床杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:f_m_q
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目的 研究Runt相关转录因子1(Runt-related transcription factor 1,RUNX1)在胃癌中的表达及其与胃癌患者临床病理特征、预后和肿瘤细胞侵袭能力之间的相关性。方法 (1)数据库分析:应用TCGA和GEO数据库分析RUNX1在胃癌和癌旁组织中的表达差异;利用Kaplan-Meier Plotter数据库分析RUNX1表达水平与胃癌患者生存预后的相关性;利用GO分析和KEGG通路富集分析RUNX1在胃癌中可能参与的功能和信号通路,并通过GEPIA数据库进行基因相关性验证。(2)临床病例验证:回顾性收集兰州大学第二医院在2018年6月至2019年12月期间收治的62例胃癌患者的癌组织和癌旁组织,进行免疫组织化学染色、HE染色和天狼星红染色,并探索RUNX1表达与患者临床病理特征和预后的关系。(3)细胞实验:利用小干扰RNA(si-001-RUNX1和si-002-RUNX1)进行RUNX1的敲减,并通过Transwell实验分析RUNX1与AGS和HGC27细胞侵袭能力的关系。结果 (1)数据库分析:RUNX1在胃癌组织中高表达,并与胃癌患者的总生存时间(overall survival,OS)呈负相关(P<0.001);GO分析和KEGG通路富集分析结果提示,RUNX1不仅参与细胞外基质(extracellular matrix,ECM)中胶原的构建,而且在ECM-受体相互作用通路中显著富集;GEPIA数据库基因相关性分析结果显示,RUNX1与ECM-受体相互作用通路所涉及基因表达呈正相关(P<0.05)。(2)临床病例验证:免疫组织化学染色结果提示,RUNX1在胃癌组织中相对高表达,且RUNX1高表达是影响胃癌患者术后OS的危险因素(RR=5.074,P=0.034);且胃癌组织中RUNX1表达与天狼星红红色面积呈正相关关系(r=0.46,P<0.001)。(3)细胞实验:Transwell实验证实RUNX1敲减后,si-001-RUNX1和si-002-RUNX1组的AGS和HGC27侵袭细胞数量降低。结论 RUNX1在胃癌中高表达且提示更差的生存预后,并且RUNX1促进胃癌发生发展有可能是通过激活ECM-受体相互作用通路实现的。
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