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利用微卫星标记和靶区域扩增多态性（target region amplification polymorphism，Trap）系列引物标记对本研究所选育4份不育系（S446A、S409A、S13A和S560A）材料进行指纹图谱构建，从294对SSR引物和8对Trap引物中筛选出22对呈多态性的引物，其中引物RM222、RM171、RM251和引物Trap2、Trap3能将花培不育系与其他8种不育系区分开，这就在DNA水平上找到它们的区别，利用这些引物对12份材料进行聚类分析表明，不育系的遗传基础均较狭窄。