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西北农林科技大学农药研究所于1999年在原西北农业大学农药研究室的基础上组建,具有独立法人资格,实行独立核算、自负盈亏、自我发展、自我约束的运行机制。从事农药,特别是天然产物农药的研究与开发。农药研究所目前有高中级固定研究人员10名,工人2名,常年在读博士生8-10人,硕士生15-20人。由吴文君教授担任研究所所长(法人代表)。