大肠埃希氏杆菌UTI89分泌蛋白组的预测分析

来源 :中国生物工程杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ASky2009
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目的:从大肠埃希氏杆菌UTI89基因组中筛选出全部潜在的分泌蛋白并进行初步研究。方法:使用SignalP3.0、TatP1.0、SecretomeP2.0等蛋白分析软件对5211个ORF进行预测;对筛选出的信号肽及分泌蛋白的基本特征进行统计学分析;使用Blast2 Sequences进行同源性分析。结果:共筛选出432个sec途径分泌蛋白,19个Tat途径分泌蛋白,386个非经典分泌蛋白;信号肽、分泌蛋白平均长度分别为25.5aa、282.8aa;信号肽中出现频率最高的3种氨基酸依次为L、A、S;仅有两个
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