【摘 要】
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【目的】分析预测申克孢子丝菌cDNA中编号为Locus168Contig1序列编码的基因及蛋白质结构、功能特征,并进行分子克隆。【方法】利用NCBI及Expasy网站提供的BLASTx、SignalIP、
【机 构】
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中山大学附属第三医院皮肤性病科,中山大学孙逸仙纪念医院皮肤性病科,中山大学中山医学院,广东省皮肤病医院
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【目的】分析预测申克孢子丝菌cDNA中编号为Locus168Contig1序列编码的基因及蛋白质结构、功能特征,并进行分子克隆。【方法】利用NCBI及Expasy网站提供的BLASTx、SignalIP、InterPro Scan等生物信息学软件分析其序列,判断其是否为全长编码序列、同源序列名称,并分析其结构、定位及功能等;将其中的全长编码区利用PCR方法进行扩增后克隆到pET-30a（+）载体,测序验证。【结果】该序列是亚精胺合成酶（SPDS）的同源基因,全长序列为1062 bp,包含完整的编码区1901 062 bp,编码291个氨基酸,在GenBank中,其与粗糙脉孢菌的SPDS基因同源性最高,达88%。理化性质预测其编码蛋白疏水性高;无质体、线粒体等定位序列,不存在跨膜螺旋结构,为非分泌型蛋白。进化树分析结果显示与粗糙脉孢菌同源性最高;PCR扩增及测序结果证实目的基因成功克隆进入pET-30a（+）质粒。【结论】获得申克孢子丝菌SPDS的基因及蛋白结构、功能特点,构建了其重组表达质粒,将为进一步明确其在孢子丝菌病中的致病作用奠定理论基础。
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