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财政部于2008年颁布实施了《新型农村合作医疗基金会计制度》（以下简称新制度），新制度颁布实施5年多的时间，对规范新型农村合作医疗基金的会计核算，加强新农合基金科学化、精细化管理，促进新农合制度的健康发展起到了重要作用。根据几年来制度的执行和操作情况，浅谈几点看法和意见。一是会计主体。新制度第三条规定：“新农合基金应当作为独立的会计主体进行确认、计量和批露。新农合基金独立于经办机构的固定资产及管理的其他财产，实行专款专用”。