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准噶尔盆地腹部发育NE、NW向为主的基底断裂和盖层断裂，侏罗系主要发育NE、NW向三角洲沉积体系。基底断裂的早期“显性”活动控制了主要二级构造带的边界、古凸起（古梁）展布、主断裂分布及四大压扭构造带的展布方向。后期NE向基底断裂的“隐性”活动导致上部盖层破碎，使早期的二叠纪古凸起带成为浅表断裂破碎带。河道水系的冲刷下切极易取其走向，从而控制了三工河组和西山窑组的主河道及主砂体沿NE向主断裂构造线及早期凸起带的展布，进而也就控制了油气藏的分布。基底断裂活动控制了油气的早期原生成藏与晚期调整次生成藏和再分配，