【摘 要】
：
为了研究别构小分子2-乙酸苯并噻吩(2FX)在HIV-1蛋白酶与抑制剂结合中的作用,利用分子动力学方法分别对未结合和结合2FX的HIV-1蛋白酶抑制剂体系进行了100 ns的模拟,模拟计算
【机 构】
：
山东师范大学物理与电子科学学院 济南250014
论文部分内容阅读
为了研究别构小分子2-乙酸苯并噻吩(2FX)在HIV-1蛋白酶与抑制剂结合中的作用,利用分子动力学方法分别对未结合和结合2FX的HIV-1蛋白酶抑制剂体系进行了100 ns的模拟,模拟计算中对每种体系均采用两种新的分子力场ff99SBildn和ff12SB.研究了2FX对体系构象的影响和两体系在不同力场下的动力学行为,分析了两体系的均方根偏差和残基的B因子,比较了计算结构和晶体结构,最后采用MM-PB/GBSA两种方法计算了两体系的结合自由能.研究表明,两种力场计算的结果虽有差异,但都说明2FX的结合导致蛋白酶构象的变化,使得体系更加稳定,尤其是flap的柔性减弱,使得蛋白酶和抑制剂的结合更牢固；另外,还发现ff12SB力场动力学过程更稳定.研究结果有助于为设计新的别构抑制剂提供理论依据.
其他文献
本文主要通过对数控机床常见故障及其分类、数控机床故障分析的基本方法的分析和总结,阐述了数控机床故障诊断、维修解决实例及方案。
This paper mainly analyzes and sums
１９９８年夏秋，当百年不遇的特大洪水袭来的时候，我们的摄影记者在哪里？他们在风雨长堤上，在汹涌怒涛中，在抢救危难的冲锋舟上，在搏击洪峰的军民中……当人民日报华南新闻编辑部将三组记者
案例: 今天中午,我在心理辅导室值班的时候,走进一位身材颀长、脸带忧郁、满怀心事的男孩,他低头站立在我面前,欲言又止。我给他倒了杯水,让他坐下。经耐心引导,他总算吞吞
有一张小报,被光明日报、经济日报、中国妇女报等首都大报相继做过介绍,并被北京公用图书馆存入档案。这张小报,在不少省市的农村、乡镇企业中被传阅,为国内外宾客称赞,它就
有一群东西是任何教学大纲和教科书、任何教学方法和教学方式都没有做出规定的,这就是儿童的幸福和充实的精神生活.
吡咯并[3,4-c]吡唑衍生的Aurora激酶抑制剂是具有良好开发前景的新型抗肿瘤药物之一.采用电喷雾-四级杆飞行时间串联质谱技术,对4种吡咯并[3,4-c]吡唑衍生的Aurora激酶抑制剂
目的 探讨支气管哮喘病儿血清白细胞介素13(IL-13)水平变化及与总IgE水平和外周血嗜酸细胞计数的相关性。 方法 选择支气管哮喘病儿35例和正常对照组20例为研究对象,血清I
诚者,天之道也;思诚者,人之道也.rn--rn作为语文老师,我很欣赏她的文学才华;我想,她大概也很喜欢我,喜欢语文课,所以毛遂自荐地做了我的课代表.我们的师生交往由此开始.我知
目的本研究旨在探讨不同影像学手段术前评估对主动脉夹层腔内隔绝术的指导意义,分析综合影像学方法对诊断主动脉夹层的可靠性,为确定主动脉夹层腔内隔绝术所选取的移植物(内
做好正确引导舆论的工作,是党的宣传思想战线一项极其重要的任务。江泽民同志在全国宣传思想工作会议上指出:“正确引导舆论,重要的是正确把握形势,增强全局观念,坚持宣传好