赤桉EcWRKY50转录因子基因的电子克隆及生物信息学分析

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  摘 要:WRKY转录因子参与植物生长发育、抗病虫、耐逆境等众多过程,并在其中起重要作用。为了研究WRKY在赤桉中的结构和功能,本研究利用电子克隆的方法克隆了赤桉与AtWRKY50高度同源的一个WRKY基因EcWRKY50,并利用生物信息学方法对该基因编码蛋白的氨基酸组成,理化性质,亚细胞定位和高级結构等方面进行预测和分析。结果表明,EcWRKY50基因全长为585 bp,包含一个480 bp的开放阅读框,编码159个氨基酸,该基因蛋白分子量为18.187 KD,理论等电点为5.45。该蛋白含有一个WRKYGKK的保守结构域和C2H2结构域,属于GroupⅡc成员,很可能在细胞质中起转录和转录调控的作用;并对该蛋白进行了同源性分析。这些研究为该基因功能的进一步分析奠定了坚实的基础。 全文查看链接   2.2 EcWRKY50蛋白氨基酸序列的一级结构预测 全文查看链接   [6] 郑益兴,段安安. 国内外赤桉育种研究回顾及云南的现状与对策[J]. 西南林学院学报,1999,19(4):258-262. 全文查看链接
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