【摘 要】
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利用外源GA3打破百蕊草种子休眠,采用高通量测序技术对百蕊草休眠种胚和休眠解除种胚进行转录组测序并进行系统的生物信息学分析.结果 表明,外源GA3可有效打破百蕊草种子休眠
【机 构】
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南京农业大学园艺学院,江苏南京210095中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所,北京100193;
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利用外源GA3打破百蕊草种子休眠,采用高通量测序技术对百蕊草休眠种胚和休眠解除种胚进行转录组测序并进行系统的生物信息学分析.结果 表明,外源GA3可有效打破百蕊草种子休眠;通过转录组测序得到上调差异基因73 794个,下调差异基因42 776个;共有116 570个差异基因被GO功能注释到代谢过程、细胞过程、细胞、细胞组分、结合和催化活性等GO条目.对26 508个差异表达基因进行Pathway显著性富集分析,共发现133个代谢通路,休眠前后DEGs主要富集在翻译、碳水化合物代谢、折叠、分类及降解和氨基酸代谢等途径,基于KEGG数据库中注释结果,共发现20条与百蕊草种子休眠解除相关的代谢通路.百蕊草种子休眠解除是一个复杂的生物学过程,包括细胞形态构建、次生代谢产物合成、糖代谢以及植物信号转导等,其中植物激素信号转导是调控休眠解除的关键因素之一.qRT-PCR验证结果显示测序结果和实际结果一致.
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