目的:筛查甲胎蛋白(α-fetoprotein,AFP)阴性的肝癌患者和肝硬化患者血清中的差异表达蛋白。方法:选择6例AFP阴性的肝癌患者和6例AFP阴性的肝硬化患者。应用MARS系统分离获得各组血清标本中的低丰度蛋白,采用双向荧光差异凝胶电泳(two-dimensional fluorescence difference gel electrophoresis,2D-DIGE)技术筛选两组间有表达差异的蛋白,并用蛋白质印迹法加以验证。结果:2D-DIGE技术共鉴定出29种差异蛋白,其中AFP阴性肝癌患者血清中高表达的蛋白有22种,低表达的蛋白有7种。差异蛋白包括激肽原1、四连接素、基膜聚糖蛋白、补体1r和锌α2糖蛋白等。蛋白质印迹法证实,AFP阴性的肝癌患者血清中锌α2糖蛋白表达水平明显低于AFP阴性的肝硬化患者(P<0.05),同DIGE结果一致。结论:采用蛋白质组学技术筛查出的一系列在AFP阴性肝硬化和AFP阴性肝癌患者血清中有表达差异的蛋白有望作为AFP阴性肝癌患者早期诊断和辅助诊断的分子标志物。